航空工程学院是北京科技职业大学下属的专业二级学院，成立于2021年11月18日。

航空工程学院是学校适应首都产业发展需求，面向首都国际机场和大兴国际机场两大航空港以及“南箭北星”航天产业布局，培养从事航空、航天技术领域的高技能人才的二级教学单位，开设职业本科专业-自动化技术与应用，以及飞机机电设备维修、飞机电子设备维修、电气自动化技术、无人机应用技术等专科专业。其中电气自动化技术专业是火箭军定向直招军士生专业；飞机机电设备维修、飞机电子设备维修专业与国航、东航签署订单人才培养协议，无人机应用技术专业与彩虹无人机科技有限公司签署订单人才培养协议。

2023年航空维修现场工程师项目入选教育部第一批职业教育现场工程师专项培养计划。2020年、2021年分别获批北京市特色高水平骨干专业群-“飞机及空港设备运维专业群”和北京市特色高水平实训基地-“北京飞机维修工程师学院”；学院是全国民航行指委航空机务维修专委会副主任委员单位、中国航空教育学会理事单位、中国民用航空维修协会会员单位；学院经中国民航局批准具有民航维修执照培训资质，可以培养持照入职的高层次航空维修技术技能人才；是经北京市人力资源和社会保障局批准的企业新型学徒制培训机构。学院现有教职员工54人，在校学生1422人。2022年学院教师团队荣获全国职业技能大赛教师教学能力大赛一等奖1项，获得北京市教育教学成果二等奖1项；学生参加各类技能竞赛获得世界技能竞赛金奖1项，国家级技能竞赛一等奖13项，省部级竞赛一等奖50余项。