航空工程学院是北京科技职业大学下属的专业二级学院，成立于2021年11月18日。

航空工程学院是学校适应首都产业发展需求，面向首都国际机场和大兴国际机场两大航空港以及“南箭北星”航天产业布局，培养从事航空、航天技术领域的高技能人才的二级教学单位，开设职业本科专业-自动化技术与应用，以及飞机机电设备维修、飞机电子设备维修、电气自动化技术、无人机应用技术等专科专业。其中电气自动化技术专业是火箭军定向直招军士生专业；飞机机电设备维修、飞机电子设备维修专业与国航、东航签署订单人才培养协议，无人机应用技术专业与彩虹无人机科技有限公司签署订单人才培养协议。